El Instituto de Biología de la UNAM identifica especies con códigos de barras genéticos a partir de muestras de tejido enviadas por PROFEPA

Nota Por: Sofía de Teresa

Como ejercicio de comprobación de la eficacia que tienen los códigos de barras genéticos como herramienta de detección de tráfico ilegal de especies protegidas, el Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM) llevó a cabo actividades de laboratorio orientadas a la identificación de especies a partir de la aplicación de la tecnología de códigos de barras de ADN.

¿De dónde provinieron los tejidos analizados?
La UNAM recibió 8 muestras de aletas de tiburón que fueron inspeccionadas por personal de la Procuraduría Federal de Protección al Ambiente (PROFEPA), y que no pudieron ser identificadas como pertenecientes a una especie determinada a partir de sus características visuales. Estas muestras de aletas de tiburón fueron tomadas por la PROFEPA en el Puerto de Manzanillo (Colima, México), y fueron posteriormente enviadas al laboratorio del IBUNAM con la intención de que se analizaran con códigos de barras genéticos, para averiguar si era posible identificar a las especies a la que esas aletas pertenecían.

¿Cómo trabajaron los científicos del IBUNAM con las muestras?
Los científicos del IBUNAM analizaron en sus laboratorios las 8 muestras que le envió el personal de la PROFEPA, y obtuvieron las secuencias de los códigos de barras genéticos. Esas secuencias fueron posteriormente comparadas con códigos de barras genéticos de referencia contenidos en GenBank y BOLD, para averiguar si las secuencias coincidían.

¿Cómo se generan y cómo funcionan los códigos de barras genéticos de referencia?
Para contar con un código de barras genético de referencia (es decir, con un código de barras de ADN que pueda servir como referente de identificación), un taxónomo debe determinar a partir de la taxonomía tradicional –principalmente a partir de las características visuales– la especie a la que pertenece un organismo; posteriormente se realiza un análisis de ADN de dicho organismo, y se obtiene el código de barras genético; ese código de barras genético se carga en una biblioteca de referencia, donde quedará disponible para realizar análisis comparativos en el futuro. Es decir, si la secuencia del código de barras genético de cierta especie es detectada mediante análisis de ADN en una muestra de tejido, podemos decir que el tejido muestreado pertenece a un individuo de esa especie. Mientras más completas sean las bases de datos de las especies y se cuente con más códigos de barras genéticos provenientes de individuos previamente identificados, será mucho más eficiente la identificación de organismos a partir del uso de códigos de barras genéticos.

Y bien… ¿Pudieron ser identificadas las especies a las que pertenecían las muestras de tejido que envió PROFEPA al IBUNAM? ¿cuáles fueron los resultados obtenidos? Los análisis de laboratorio realizados por el IBUNAM pudieron determinar en forma exitosa la especie a la que pertenecían las muestras de tejido, y esto significa que los códigos de barras genéticos son capaces de ayudar a identificar especies a partir del análisis de la secuencia de ADN. Los resultados obtenidos en el IBUNAM determinaron que las especies a las que pertenecían las muestras de tejido fueron:

En esta tabla se presenta el nombre de la especie, y el porcentaje de parecido encontrado al comparar con muestras de BOLD y GenBank.

Posteriormente, el IBUNAM entregó los resultados del análisis a PROFEPA en un documento con firma del M. en C. Héctor Espinosa Pérez (curador de la Colección Nacional de Peces del IBUNAM).


Algunos datos relevantes sobre las especies identificadas son:

• Alopias pelagicus (muestras 1–2, 7–8)

Características biológicas: es una especie inofensiva para la gente; su hábitat es principalmente oceánico, y puede ser encontrado desde la superficie del océano hasta los 152 metros de profundidad; en ocasiones ha sido observado cerca de arrecifes de coral, de hondonadas y en grandes lagunas. Son excelentes nadadores, y se piensa que probablemente se trata de una especie con actividades migratorias poco conocidas. Su área de distribución es:

Estado de conservación: se encuentra en la categoría vulnerable (VU) de la Lista Roja de las Especies de la UICN, y debido a su baja fecundidad y relativamente alta edad de madurez sexual, es extremadamente vulnerable a la sobreexplotación. A pesar de ello, la pesca de estos organismos no está regulada por CITES. En el caso de México, su explotación se encuentra regulada por el Apéndice A de la NOM–029–PESC–2006.
Explotación humana: ha sido principalmente explotado por su carne como fuente de alimento para los humanos, incluidas sus aletas (utilizadas para elaborar caldo de tiburón), y el aceite de su hígado (aprovechado para extraer vitamina A). Históricamente, su zona de captura se comprende por el noroeste del Océano Índico, el Pacífico Central, Taiwán, California (Estados Unidos), el Pacífico de México y el Golfo de California. También ha sido capturado en el Mar Rojo, y en el Golfo de Adén.

• Rhizoprionodon longurio (muestras 3–4)

Especie participante en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México (BWPM).
Características biológicas: es un tiburón pequeño que se alimenta principalmente de peces óseos, camarones, cangrejos, pulpos y calamares. Las crías se desarrollan dentro de la madre (son vivíparos). Habitan el océano Pacífico, desde California (Estados Unidos) hasta Perú.
Estado de conservación: su estado de conservación es incierto, pues falta información sobre las poblaciones de estos organismos. Esta especie no está protegida por las leyes mexicanas ni por la CITES.
Explotación humana: son capturados para consumo humano (ya sea frescos o congelados), y para la fabricación de harina de pescado. También suelen ser atrapados incidentalmente durante otras actividades pesqueras.

• Carcharhinus limbatus (muestras 5–6)

Características biológicas: es una especie de tamaño mediano que generalmente habita en aguas cercanas a la costa; puede ser hallado en playas, bahías, estuarios, arrecifes de coral y en las desembocaduras de los ríos. Se alimenta principalmente de peces óseos y, también, de pequeñas cantidades de crustáceos como camarones y cangrejos. Su área de distribución es extensa, y abarca el Atlántico (sureste, este central, oeste central y noreste), el Océano Índico (este y oeste), el Mediterráneo, el Mar Negro, y el Pacífico (este central, sureste y noroeste).
Estado de conservación: se encuentra en la categoría de especie casi amenazada (NT) de la Lista Roja de las Especies de la UICN. El hecho de habitar aguas costeras lo hace más vulnerable que otros organismos a la captura humana y a la alteración de su hábitat. El comercio de esta especie no está regulado por CITES. En el caso de México, su explotación se encuentra regulada por el Apéndice A de la NOM–029–PESC–2006.
Explotación humana: frecuentemente capturado durante actividades pesqueras tanto recreativas como comerciales; tanto su carne como sus aletas son muy apreciadas.

Síguele la pista a este proyecto, y conoce la historia de cómo un grupo apasionado de científicos se comprometieron a realizar una biblioteca de referencia de códigos de barras genéticos enfocados a identificar 200 especies mexicanas que frecuentemente circulan ilegalmente en el mercado, más 800 especies que pueden ser fácilmente confundidas o que están cercanamente emparentadas con ellas… si tomamos en cuenta que cada especie contará con tres códigos de barras genéticos, eso significa que el equipo mexicano del IBUNAM aportará al proyecto internacional Códigos de Barras de la Vida Silvestre (BWP por sus siglas en inglés) un total de 3000 códigos de barras genéticos de referencia.

Agradecemos a todas las instituciones y expertos que nos han acompañado a lo largo de este proceso, y que colaboraron en este proyecto para hacer posible que Códigos de Barras de la Vida Silvestre México tuviera acceso a muestras de organismos pertenecientes a las especies participantes. También agradecemos el entusiasmo y apoyo del público mexicano e internacional que ha seguido de cerca el proceso de realización de este proyecto orientado a la protección de especies de flora y fauna mexicana afectada por el tráfico ilegal.

Recomendaciones
Si deseas saber más sobre el tráfico de tiburón, te recomendamos este artículo de la Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora Silvestres (CITES).


Fuentes

CITES. Checklist of CITES species. (s.f.). Consulta: 25 de enero de 2016.

Diario oficial. NOM–029–PESC–2006, Primera Sección. (2006). México. Pp. 1, 16, 18.

FAO. Sharks of the world, Alopias pelagicus Nakamura, 1935. (s.f.). pp. 81–82, 83.

Velarde G. Cazón bironche: Rhizoprionodon longurio. (s.f.). Códigos de Barras de la Vida Silvestre México (BWPM). Consultado el: 25 de enero de 2016.

IUCN. Red List of Threatened Species. Alopias pelagicus. (2004). Consultado el: 25 de enero de 2016.

IUCN. Red List of Threatened Species. Carcharhinus limbatus. (2004). Consultado el: 25 de enero de 2016.


Fotografías

1. Alogias pelagicus, Rafn Ingi Finnsson CC BY-NC-SA.
2. Alogias pelagicus, mapa. Chris_huh CC BY-SA 3.0
3. Rhizoprionodon longurio. CICIMAR/CONABIO, Banco de Imágenes de CONABIO.
4. Rhizoprionodon longurio, mapa. Chris_huh CC BY-SA 3.0
5. Carcharhinus limbatus, Albert Kok, Dominio Público.
6. Carcharhinus limbatus, mapa. Chris_huh CC BY-SA 3.0

Códigos de Barras de la Vida Silvestre México en MEXBOL

La 3ª Reunión Nacional de la Red MEXBOL fue llevada a cabo del 23 al 27 de Noviembre de 2015 en las las instalaciones del Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM, Ciudad Universitaria, México D.F.).

Como parte de las actividades de esta 3ª Reunión, miembros del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México ofrecieron a personal de la PROFEPA, PGR y PFP, el Taller toma y procesamiento de muestras biológicas para obtención de códigos de barras genéticos.

En dicho taller, la Dra. Virginia León Régagnon (IBUNAM) impartió la charla Introducción al Proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre en México (BWPM por sus siglas en inglés), donde expuso la importancia y avances del proyecto BWPM a los asistentes; mencionó a los miembros que están haciendo posible la realización de este proyecto en México y otros países del mundo, y explicó que se están llevando a cabo actividades de difusión a nivel nacional e internacional.

Posteriormente, la M. en C. Andrea Jiménez Marín explicó a los asistentes los procedimientos de toma de muestras de fauna silvestre, la Dra. Lidia Cabrera Martínez ofreció la capacitación de procedimientos de toma de muestras de flora silvestre y especies forestales, y la Biól. Patricia Rosas Escobar detalló la forma en la que se realiza la obtención de los códigos de barras genéticos en el laboratorio.

Aunque los códigos de barras genéticos de la biblioteca de referencia de este proyecto fueron generados por científicos del IBUNAM, desde sus inicios, se contempló como parte de las actividades de este proyecto el instruir al personal de las autoridades encargadas de perseguir el tráfico de especies en las técnicas de generación de códigos de barras genéticos. Sin embargo, es importante resaltar que los inspectores no generarán códigos de barras genéticos para la biblioteca de referencia de códigos de barras genéticos del proyecto.

Al final del taller, Erika del Carmen Puente González y Nadia Montes Silva hablaron a los presentes sobre la cadena de custodia; es decir, los procedimientos que deben llevarse a cabo para garantizar, una vez que las muestras han sido tomadas, que no sean alteradas, sustituidas o contaminadas, y así puedan funcionar como evidencia en un juicio contra el tráfico de especies.

Posteriormente, se le ofreció a los inspectores un recorrido por los laboratorios de zoología y botánica del IBUNAM, donde conocieron el equipo e infraestructura utilizados para realizar análisis genéticos de vida silvestre.

Más adelante fueron entregados kits de material para la recolecta y preservación de muestras para análisis genético tanto de plantas como de animales, a la Dirección General de Inspección Ambiental en Puertos, Aeropuertos y Fronteras de la PROFEPA. Todos estos materiales fueron donados por el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México con la intención de incentivar el establecimiento de la técnica de códigos de barras genéticos en el combate del tráfico ilegal de especies en México.

Mesa de trabajo
Durante la reunión se formaron mesas de trabajo sobre diversos temas, entre ellas se formó una mesa para discutir sobre las opciones de financiamiento para la creación y mantenimiento del laboratorio forense para la vida silvestre en México, donde participaron investigadores y autoridades gubernamentales miembros del Consejo Nacional del Proyecto.

Fotografías

1–4, 6. Angélica Najar Pacheco
5. Carmen Loyola

El equipo de botánica del IBUNAM obtiene muestras de tejido y extrae el ADN de más de 300 especies vegetales participantes en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México

Nota Por: Sofía de Teresa

México D.F. 14 de mayo, 2015. El equipo de científicos del Laboratorio de Sistemática Molecular Botánica II del Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM), logró obtener muestras de tejido de 570 ejemplares pertenecientes a 303 especies participantes en el proyecto, y ya extrajo a partir de estas 570 muestras, el ADN necesario para generar los códigos de barras genéticos que formarán parte de una biblioteca pública de referencia que pueda ser utilizada por las autoridades mexicanas para proteger especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal.

El equipo de botánica del IBUNAM ha estado trabajando por largo tiempo para contribuir con la generación de una biblioteca pública de referencia que pueda ser utilizada por las autoridades federales para proteger especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal. Da click en los botones de la galería para leer los subtítulos.


Las actividades de este laboratorio se encuentran a cargo de la Dra. Lidia Cabrera Martínez; sus ayudantes son Claudia Lizbeth Montealegre Zúñiga y Mónica Adriana Flores Iniestres; todas ellas, del IBUNAM.


¿Cuántas especies de plantas están participando en este proyecto?

Aproximadamente 500 especies de plantas se encuentran participando en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México. De esas especies, 87 están reconocidas como prioritarias y suelen ser traficadas ilegalmente ya sea vivas, en forma de trozos o productos. El resto de las especies vegetales participantes están cercanamente emparentadas o podrían confundirse fácilmente con ellas.

Para llevar un registro preciso de las muestras, tanto los tubos como las cajas que resguardan los tejidos, van asociados a un número único y a un código de barras que permiten de manera rápida y eficiente dar seguimiento a todo el material.


¿Por qué se tomaron muestras de tejido de 570 ejemplares vegetales?

Con el fin de garantizar que la biblioteca pública de referencia de códigos de barras de ADN ofrezca el mayor nivel de certidumbre posible y funcione como herramienta eficaz de detección de tráfico ilegal de especies amenazadas, se generará un mínimo de 3 códigos de barras genéticos por especie a partir de pequeñas muestras de tejido provenientes de ejemplares distintos. De manera que el equipo del Laboratorio de Sistemática Molecular Botánica II del IBUNAM, deberá procesar las muestras de al menos 1,500 ejemplares para generar la cantidad mínima requerida de códigos de barras genéticos de las especies de plantas participantes en este proyecto.

Para garantizar la óptima conservación de los individuos muestreados, se están llevando a cabo procedimientos poco invasivos que permiten obtener pequeñas muestras de tejido –máximo de 1cm²– correspondientes a áreas poco visibles y que no son indispensables para la identificación visual de los organismos.


¿Cómo ayuda a elevar el nivel de certidumbre de la biblioteca de referencia el tomar muestras de ejemplares distintos?

La secuencia de los códigos de barras genéticos es muy similar en organismos que pertenecen a una misma especie. De esta forma, el hecho de contar con 3 códigos de barras genéticos permite conocer el grado de variación que existe entre las secuencias de individuos de la misma especie, y así, poder constatar que las secuencias corresponden a la especie que se desea identificar.

Como la intención de este proyecto es crear una biblioteca pública de referencia que sirva para detectar el tráfico de especies y fortalecer la evidencia en juicios, es indispensable que en todo momento pueda demostrarse que la información que contendrá la biblioteca de referencia es precisa; sólo así, los traficantes podrán ser procesados.


¿De dónde provienen las muestras de tejido que serán utilizadas para generar los códigos de barras genéticos?

La mayoría de las muestras fueron tomadas de ejemplares resguardados por el Herbario Nacional del IBUNAM, que constituye la principal colección biológica de especies vegetales mexicanas, y cuenta con más de 1300 000 ejemplares.

Las vastas colecciones del Herbario Nacional se ubican en el Instituto de Biología de la UNAM, y son preservadas en salones especiales que pueden ser visitados por expertos y ciudadanos interesados en la biodiversidad.

En los casos donde las especies no se encontraban, o no fue posible disponer del número necesario de individuos en el Herbario Nacional para generar los códigos de barras genéticos requeridos por especie para el proyecto, taxónomos expertos del IBUNAM donaron muestras de tejido adecuadamente preservadas en sus colecciones biológicas. Todos los tejidos donados al proyecto por taxónomos expertos, cuentan ahora con un ejemplar de respaldo recientemente incorporado a la colección del Herbario Nacional, y podrán ser consultados por especialistas y ciudadanos interesados en conocer la biodiversidad mexicana.

Todas las muestras fueron tomadas a partir de especímenes previamente identificados por taxónomos expertos en cada uno de los grupos.

Especie participante en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México resguardado en el Herbario Nacional.

Sólo se eligieron ejemplares y colecciones biológicas que cuentan con información suficiente para comprobar el origen de los tejidos (quién identificó el ejemplar del que proviene la muestra, en qué colección biológica se encuentra depositado el tejido o el ejemplar del que fue tomada, características biológicas del organismo al que pertenecía la muestra de tejido, y evidencia física de su existencia –muestras de tejido, fotografías depositadas en colecciones biológicas en los casos en que se haya llevado a cabo recolecta en campo, el ejemplar completo depositado en la colección biológica–). Esta información irá asociada a los códigos de barras genéticos, y podrá ser consultada a través de internet.


¿Cuáles son algunas de las especies ya muestreadas?

Da click sobre los links y conoce algunas de las especies vegetales participantes en el proyecto que ya fueron muestreadas: Peyote (Lophophora williamsii), Granadillo (Dalbergia granadillo), Candelilla (Euphorbia antisyphilitica), Maguey tepeztate (Agave marmorata), Biznaga jirafa (Turbinicarpus subterraneus), Biznaga cochilinque (Mammillaria pectinifera), Pata de elefante (Beaucarnea gracilis), Biznaga cono invertido (Turbinicarpus hoferi), Amole (Yucca rostrata), Cuitlauzina perfumada Cuitlauzina pendula, Palo de águila (Laelia superbiens), Guayacan (Guaiacum angustifolium), Caoba (Swietenia macrophylla).


Agradecimientos

¡Agradecemos al Herbario Nacional la posibilidad de tomar muestras de tejido de sus vastas colecciones, así como el apoyo y colaboración de todos los expertos que participaron donando tejidos y apoyando con la ardua tarea de corroborar la correcta identificación de los ejemplares de herbario antes de realizar el proceso de muestreo!

Dr. Gerardo A. Salazar: por la donación de muestras en gel de sílice de 134 especies pertenecientes a 43 géneros de la familia Orchidaceae, y apoyo con el reconocimiento de ejemplares de herbario.

Dr. Salvador Arias Montes: por la donación de muestras en gel de sílice de 75 especies de la familia Cactaceae y apoyo con el reconocimiento de ejemplares de herbario.

Dr. Abisaí J. García Mendoza: por el reconocimiento de ejemplares de herbario de 67 especies de la familia Asparagaceae.

Dr. José Ledis Linares: por el reconocimiento de ejemplares de herbario de 14 especies de la familia Fabaceae, género Dalbergia.

Dra. Jeny Solange Sotuyo: por el reconocimiento de ejemplares de herbario de 17 especies de la familia Fabaceae, géneros Lonchocarpus, Peltogyne, Olneya, Hymenaea, Heteroflorum, Caesalpinia y Swartzia.

Biól. Esteban Martínez Salas: por el reconocimiento de ejemplares de herbario de 35 especies de las familias Moraceae, Anacardiaceae, Burseraceae, Euphorbiaceae, Meliaceae, Rubiaceae, Sapotaceae, y Zygophillaceae.


Recomendaciones

Si deseas saber más sobre qué procedimientos siguieron los científicos para tomar muestras de tejido de los ejemplares de herbario y extraer el ADN, da click aquí.

Conoce más sobre el Herbario Nacional dando click aquí.


Fotografías:

I. Galería IBUNAM Avances Equipo Botánica 2015: 1–2, 4–5. Sofía de Teresa // 3. Lidia Cabrera // 6. Mónica Flores Iniestres. CC BY-NC-ND, Creative Commons; se prohibe el uso comercial de las imágenes y realizar modificaciones; debe darse crédito al autor para hacer uso de las imágenes.

II–III. Galería Muestras de Tejido del equipo de Botánica del IBUNAM, El Herbario Nacional: Sofía de Teresa. CC BY-NC-ND, Creative Commons; se prohibe el uso comercial de las imágenes y realizar modificaciones; debe darse crédito al autor para hacer uso de las imágenes.

IV. Espécimen de Herbario Nacional: Mónica Flores Iniestres CC BY-NC-ND. Creative Commons: se prohibe el uso comercial de las imágenes así como realizar modificaciones; debe darse crédito al autor para hacer uso de las fotografías.

Científicos del Instituto de Biología de la UNAM recolectan especies difíciles de hallar en su hábitat natural en apartadas regiones del norte de México

Científicos del Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM) se adentran en zonas retiradas de los estados de Sonora, Sinaloa y Nayarit, con la misión de recolectar muestras de tejido de organismos pertenecientes a especies participantes en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México, que suelen ser difíciles de hallar en su hábitat natural, y que en ocasiones no están representadas o se cuenta con muy pocos ejemplares disponibles en las Colecciones Nacionales resguardadas por el IBUNAM.

Para ver en grande las fotos de las especies halladas en estas actividades, da click sobre este texto.

Afortunadamente, el viaje se realizó sin contratiempos y los científicos regresaron sanos y salvos a la Ciudad de México con los tejidos de varias de las especies participantes en el proyecto.

Los ejemplares recolectados pasarán a formar parte de las extensas Colecciones Nacionales del IBUNAM, y quedarán disponibles para su uso en otras investigaciones, impulsando con ello no sólo a éste, sino también, a muchos otros proyectos realizados en México y otros lugares del mundo.

Las actividades de recolecta se llevaron a cabo en 16 localidades diferentes, del 26 de noviembre al 9 de diciembre de 2014, y el equipo de trabajo estuvo integrado por: Katia E. Juárez (Mamíferos), Moisés López (Mamíferos), Eric Centenero (Reptiles), Gerardo Contreras (Arácnidos) y Jorge Mendoza (Arácnidos).

Cabe destacar que en este viaje se logró hallar muestras de especies como Brachypelma emilia, tarántula mexicana cuyas poblaciones se han visto disminuidas por la destrucción de su hábitat y el tráfico ilegal.

También se obtuvieron varias muestras de mamíferos y algunas de reptiles, incluyendo especies como Crotalus atrox. Considerando que las recolectas no se realizaron en la mejor temporada para hallar especies de reptiles, podemos afirmar que todas las actividades resultaron exitosas.

Posteriormente, el equipo del Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del IBUNAM extraerá el ADN de las muestras de tejido obtenidas en estas actividades, y generará los códigos de barras genéticos del proyecto para seguir contribuyendo con generación de una herramienta pública que las autoridades federales puedan utilizar para proteger especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal.

A continuación, los científicos del IBUNAM que participaron en estas actividades realizadas con el apoyo de una beca Google Global Impact Awards, nos comentan sobre los lugares visitados y las especies que lograron recolectar en cada uno de ellos:

Altar (Sonora)

Tras dos largos días de viaje, llegamos sin contratiempos a esta región de México con el objetivo principal de obtener muestras de Brachypelma emilia. Aunque por dos días consecutivos realizamos intensas labores de búsqueda de ejemplares de esta especie en cinco localidades distintas, en esta ocasión no fue posible hallar Brachypelma emilia en la región. Sin embargo, logramos obtener muestras de otras especies participantes en el proyecto:

2 – Aphonopelma sp.^* (tarántulas)

1 – Crotalus atrox (víbora de cascabel)

^* Ejemplares en proceso de identificación a nivel de especie.

Yécora y Sierra Madre Occidental (Sonora)

A diferencia del Altar, Yécora se encuentra en una región de gran altitud; por lo que nos ofreció la oportunidad de hallar especies muy distintas a las que habitan en el Altar. Como hubo advertencias de inseguridad en la zona, nos fue imposible realizar recolectas nocturnas, y llevamos a cabo las labores de búsqueda de ejemplares entre las 8 a.m. y las 5 p.m., logrando recolectar muestras de:

1 – Aphonopelma sp. (tarántula)

Mazatlán (Sinaloa)

En esta localidad, hallamos ejemplares de Brachypelma emilia y otros organismos que suelen habitar en zonas cercanas a la costa. Por dos días realizamos intensas actividades de recolecta en cuatro localidades, y logramos obtener:

4 – Brachypelma emilia (tanto hembras como machos adultos)

2 – Aphonopelma sp. (tarántulas)

2 – Kinosternum integrum (tortugas)

Municipios de Ruíz y Acaponeta (Nayarit)

En esta zona del estado de Nayarit obtuvimos más muestras de Brachypelma emilia. Sin embargo, en esta ocasión no hallamos ni mamíferos ni reptiles. En estos municipios recolectamos muestras de:

5 – Brachypelma emilia (tarántulas)

2 – Aphonopelma sp. (tarántulas)

Fotografías: Jorge I. Mendoza, CC BY-NC-ND, 2015. // Kinosternon integrum y Crotalus atrox por: Eric Centenero Alcalá, CC BY-NC-ND, 2015. Se prohíbe el uso comercial de estas imágenes, así como realizar modificaciones. Debe darse crédito al autor para utilizar estas fotografías. Creative Commons.

El Herpetario del Zoológico de Chapultepec colabora con el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México

Nota Por: Sofía de Teresa


México D.F. a 16 de abril de 2015. El emblemático zoológico de Chapultepec (considerado como el Zoológico Nacional y reconocido como uno de los más importantes de América Latina), cuenta con un herpetario dedicado a la conservación de distintas especies de serpientes, tortugas, anfibios y lagartos provenientes de México y otras regiones del planeta.



Generosamente, a principios del presente año, el equipo de expertos de Proyectos Zoológicos A. C que se encuentra a cargo del Herpetario del Zoológico de Chapultepec, respondió con entusiasmo a la invitación del comité científico del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México  (Barcode of Wildlife México), y accedió a colaborar con la toma de muestras de tejido de algunas especies de reptiles participantes en el proyecto que están presentes en su colección biológica, y que suelen ser difíciles de hallar en su hábitat natural debido a que cuentan con poblaciones pequeñas, o tienen una distribución muy restringida en los ecosistemas.

Ahora, gracias a la colaboración del Herpetario del Zoológico de Chapultepec, el equipo de científicos del Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM), podrá generar los códigos de barras genéticos públicos para estos organismos, y así continuar avanzando con la creación de una biblioteca de referencia que pueda ser utilizada por las autoridades federales como herramienta para proteger a especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal.

La recolecta se llevó a cabo el 17 de febrero de 2015 dentro de las instalaciones del Herpetario del Zoológico de Chapultepec, y fueron muestreadas 7 especies de serpientes, una de cocodrilo, y una de lagarto. Para conocer a los organismos muestreados, da click sobre los links: víbora de cascabel del Altiplano (Crotalus scutulatus), cascabel obscura de Querétaro (Crotalus aquilus), víbora de cascabel gris (Crotalus lepidus), víbora de cascabel pigmea mexicana (Crotalus ravus), víbora de cascabel ocelada (Crotalus polystictus), cascabel de Baja California (Crotalus enyo), cascabel manchada (Crotalus mitchelli), cocodrilo de pantano (Crocodylus moreletii) y el lagarto alicante (Abronia deppii).


Agradecimientos

¡Damos las gracias al Herpetario del Zoológico de Chapultepec por su valiosa colaboración con la protección de las especies mexicanas del tráfico ilegal!

Agradecemos muy especialmente al equipo de Proyectos Zoológicos A. C. por su importante colaboración en estas actividades, al M. en C. Juan Carlos Navarro García por su apoyo en la gestión de la participación de Prozoo A. C. y colaboración en el manejo de la fauna muestreada; a la Biol. Nancy Adriana Bustos Muñoz, al Biol. Juan Clemente Ramírez Leal y al M. V. Z. Gerardo Habner Salgado, por su ayuda en el manejo de fauna y toma de muestras.


Recomendaciones

Ubicado en uno de los lugares más emblemáticos de la Ciudad de México y considerado como uno de los zoológicos más importantes de América Latina, el Zoológico de Chapultepec resguarda en su interior 1400 animales pertenecientes a 240 especies diferentes,  incluyendo mamíferos, aves, reptiles y anfibios provenientes de México y el mundo, que se encuentran distribuidos en zonas bioclimáticas. Además, del Herpetario, en sus instalaciones podemos visitar un aviario y un Mariposario donde conoceremos especies como la mariposa monarca y otros interesantes insectos.

La entrada es gratuita (a excepción del Herpetario –que tiene un costo de $35.00 por persona–, y el Mariposario –con un costo de $40.00 por persona–); sus puertas permanecen abiertas de martes a domingo de las 9 de la mañana a las 4:30 de la tarde, prácticamente todos los días del año.

Algunas de las especies que podemos conocer en su interior son el Panda gigante, el Gorila de tierras bajas, el Pingüino, el Ajolote de Xochimilco, el Jaguar, y el Conejo de los volcanes. Además, el zoológico de Chapultepec también se encuentra desarrollando programas de reproducción, conservación e investigación de especies prioritarias como el Lobo mexicano y el Cóndor de California.

¡Date una vuelta por el Zoológico de Chapultepec y aprende más sobre la naturaleza en compañía de amigos y familiares! Para saber cómo llegar y conocer más sobre este importante zoológico, da click aquí.



Para conocer más sobre el Herpetario del Zoológico de Chapultepec visita:

http://www.prozoo.com/espanol/home.html

http://www.chapultepec.com.mx/visita.asp?Lugar=163

Fotografías:

Oscar Pérez Flores, CC BY-NC-ND, 2015. Se prohíbe su uso comercial y modificaciones, debe darse crédito al autor para utilizar la imagen. Creative Commons.

CIBNOR, institución participante en el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México, contribuye con la protección de especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal

¿Qué es CIBNOR y cuál es su importancia para nuestro país y el desarrollo del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México?

El Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S.C. (CIBNOR) –creado en 1975 por el Gobierno del Estado de Baja California Sur y el CONACYT– es un centro público de investigación en el campo de las ciencias biológicas, y en el uso, manejo y preservación de los recursos naturales de México, que cuenta con reconocimiento en el ámbito nacional e internacional.

Desde 2008, CIBNOR –junto con el Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM) y El Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR-Chetumal)–, forma parte del Laboratorio Nacional de Códigos de Barras de la Vida; creado en nuestro país con la intención de generar conocimiento sobre las especies mexicanas a partir de la tecnología de códigos de barras de ADN. Cada uno de los nodos del Laboratorio Nacional opera en distintas regiones del territorio mexicano –CIBNOR en el norte, IBUNAM en el centro y ECOSUR en el sur–, impulsando y desarrollando labores de investigación sobre las distintas especies que habitan en un país megadiverso como el nuestro, a través de instituciones de investigación de alto nivel.

El equipo de científicos de CIBNOR que está colaborando al interior de este proyecto está conformado por:

•   Dr. Daniel Lluch-Cota (Director General de CIBNOR), Responsable del Nodo CIBNOR y Coordinador del equipo de científicos participantes en CIBNOR.
•  Dra. Patricia Cortés-Calva (Representante del Nodo CIBNOR ante el Laboratorio Nacional de Código de Barras de la Vida e investigadora asociada a la Colección de Mamíferos del CIBNOR), se encuentra a cargo de realizar labores de obtención de muestras de tejido para generación de códigos de barras genéticos, a través de la vinculación con expertos e instituciones especializadas en conservación, y la coordinación de actividades de colecta en campo de algunas especies participantes en el proyecto.
•   M en C. Griselda Gallegos-Simental (Responsable Técnico del Laboratorio del Nodo CIBNOR), está a cargo de llevar a cabo los protocolos de técnicas moleculares para la generación de los códigos de barras genéticos, que CIBNOR aportará para la formación de la Biblioteca de Referencia de este proyecto.
•   Biól. Mayra de la Paz-Cuevas (Responsable Técnico del Laboratorio de Mastozoolcciones de CIBNOR), participa en actividades necesarias para la obtención de códigos de barras genéticos, como son la preparación de los tejidos para que puedan ser manipulados a partir de técnicas moleculares, así como la colecta de tejidos en campo.


¿Con qué especies está colaborando CIBNOR en este proyecto y cómo se han obtenido los tejidos que serán utilizados para generar los códigos de barras genéticos?

En este proyecto, CIBNOR se encuentra trabajando con especies que se distribuyen en el norte y noroeste de México –principalmente mamíferos como el bisonte americano (Bison bison), el berrendo peninsular (Antilocapra americana), y algunas especies de mamíferos marinos como el delfín común de rostro largo (Delphinus capensis), la ballena jorobada (Megaptera novaeangliae), y el lobo marino californiano (Zalophus californianus)–; cuyas muestras de tejido para generación de códigos de barras genéticos resultan particularmente difíciles de conseguir porque, explica la Dra. Patricia Cortés-Calva, “están protegidas por la Norma Oficial Mexicana 059 (NOM-059-SEMARNAT-2010); algunas de las especies se consideran de distribución restringida, y/o se encuentran escasamente representadas en las Colecciones Nacionales”. Además, el nodo CIBNOR está apoyando con la obtención de tejidos y generación de códigos de barras genéticos de algunas especies de reptiles y pepinos de mar, que están siendo afectadas por el tráfico de vida silvestre.

“En este momento –comentó la Dra. Cortés-Calva– el personal de laboratorio de CIBNOR ya logró obtener las secuencias de ADN necesarias para generar los códigos de barras genéticos de nueve especies de mamíferos (terrestres, voladores y marinos), que se encuentran participando en el proyecto”. Algunas de estas especies son: la Ballena jorobada (Megaptera novaeangliae), el delfín de rostro largo (Delphinus capensis) y, el lobo marino californiano (Zalophus californianus).

La investigadora destacó que la labor de vinculación con taxónomos expertos e investigadores altamente especializados en los grupos zoológicos ha sido clave para obtener las muestras de tejido: “por ejemplo –mencionó–, el Dr. David Aurioles-Gamboa y la Dra. Claudia Hernández del Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas (CICIMAR) nos proporcionaron muestras del lobo marino; el Dr. Jorge Urbán y su equipo de trabajo de la Universidad Autónoma de Baja California Sur (UABCS) apoyaron con tejido de especies como la ballena jorobada y el delfín de rostro largo; el Dr. Sergio Ticul Álvarez-Castañeda  (CIBNOR) apoyó con muestras de mamíferos; por otro lado, el Dr. Carlos Sánchez-Ortiz y sus colaboradores, nos donaron muestras de pepino de mar –Isostichopus fuscus– que, aunque no están en foco rojo en CITES, sí son explotadas de forma agresiva o se parecen mucho a especies que están amenazadas. En cuanto al grupo de reptiles, tenemos el apoyo de la Dra. Ana Gatica de la Universidad Autónoma de Ciudad Juárez, Chihuahua. En el caso del bisonte, los tejidos se obtuvieron gracias a la colaboración del personal de TNC de la Reserva Ecológica El Uno (Chihuahua)”.

Por otro lado, CIBNOR cuenta con una importante colección de tejidos donde están representadas algunas de las especies participantes: “desde hace aproximadamente 20 años contamos con una importante colección de tejidos de mamíferos de México, con énfasis en especies que se distribuyen en el noroeste mexicano; las muestras se encuentran preservadas adecuadamente y pueden ser utilizadas en investigaciones diversas, incluidas aquellas que requieren de la aplicación de técnicas moleculares –comentó la Dra. Cortés-Calva–. Por esta razón, tan sólo después de las grandes Colecciones Nacionales del IBUNAM, del Politécnico Nacional y de la UAM Iztapalapa, la Colección de Mamíferos del CIBNOR se encuentra entre las más importantes del país”.

La colección accesoria de tejidos de mamíferos de CIBNOR está certificada en el ámbito nacional e internacional, y gracias a su existencia fue posible obtener muestras de especies como: murciélagos (Artibeus jamaicensis, A. lituratus, Leptonycteris curasoae[yerbabuenae], Pteronotus parnellii); el conejo del desierto (Sylvilagus audubonii); el cacomixtle norteño (Bassariscus astutus); la liebre (Lepus californicus); el coyote (Canis latrans); el berrendo (Antilocapra americana) y el lobo marino (Zalophus californianus).


¿Cuáles han sido los mayores retos a los que se ha afrontado el equipo de CIBNOR al interior de este proyecto?

En relación a las actividades de laboratorio, la M. en C. Griselda Gallegos-Simental nos explica que: “uno de los mayores retos en la parte técnica es que estamos hablando de organismos protegidos y, como no es fácil obtener permiso de colecta, nos vemos muchas veces en la necesidad de trabajar con muestras que no se encuentran en las condiciones ideales para realizar extracción de ADN. Por ejemplo, en el caso del berrendo peninsular –que es una especie protegida–, el personal de la Reserva de la Biósfera El Vizcaíno nos proporcionó el tejido que queda cuando le perforan las orejas a los organismos recién nacidos para ponerles una etiqueta; esa porción de tejido es la única a la que tenemos acceso”.

Para sortear la dificultad de extraer el ADN necesario para generar los códigos de barras genéticos, mencionó la M. en C. Gallegos-Simental, “debemos realizar muchas pruebas en laboratorio y hacer todo lo posible para obtener las secuencias de ADN con la calidad requerida para ser utilizadas en procesos de comparación taxonómica orientados a la identificación de especies que están siendo traficadas ilegalmente. Aunque estas muestras no fueron preservadas especialmente para su manipulación con técnicas moleculares, su donación para el proyecto es fundamental porque nos abre la posibilidad de generar el código de barras genético”.

Agradecimientos

¡Agradecemos la generosidad y entusiasmo con que han colaborado todos los especialistas e instituciones que apoyaron en las labores de obtención de muestras de tejido de las especies asignadas a CIBNOR!

Gracias a su colaboración, el nodo CIBNOR contribuye con la generación de los códigos de barras genéticos que formarán parte de una biblioteca de referencia, pública y gratuita, que pueda ser utilizada por las autoridades como herramienta para controlar el tráfico de especies mexicanas.


Fotografías:

1. Natasha de Vere CC BY-NC-ND // 2. CIBNOR CC BY-NC-ND // 3–4. Patricia Cortés-Calva CC BY-NC-ND // 5. CIBNOR CC BY-NC-ND

El Zoológico Guadalajara participa en el proyecto Código de Barras de la Vida Silvestre México, para proteger a especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal

Nota Por: Sofía de Teresa

México D. F. a 19 de Febrero de 2015. El Zoológico Guadalajara (ZooGDL) abrió sus puertas al público en marzo de 1988 y es uno de los zoológicos más importantes de México. En su interior alberga 3,885 ejemplares pertenecientes a 392 especies, incluyendo mamíferos, aves, reptiles, anfibios y peces, que se encuentran en espacios adecuados para su supervivencia, y bajo los cuidados de personal especializado.


Espera unos segundos a que se carguen las imágenes, o da click sobre este texto para visualizar el trabajo realizado en ZooGDL para Códigos de Barras de la Vida Silvestre México.

Considerando la amplia experiencia en el manejo de ejemplares silvestres que posee este zoológico, así como la vastedad de sus colecciones, el comité científico del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México invitó al ZooGDL a colaborar con la toma de muestras de tejido de organismos pertenecientes a especies participantes en el proyecto, y así continuar avanzando en la generación de la biblioteca pública de referencia de códigos de barras genéticos, que funcionará como herramienta para proteger a especies mexicanas amenazadas por el tráfico ilegal.

El personal del ZooGDL respondió con entusiasmo a la propuesta, y gracias a su colaboración, los científicos que se encuentran trabajando en el Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del IBUNAM, cuentan ahora con las muestras de tejido necesarias para generar códigos de barras genéticos de 29 especies de animales participantes en el proyecto.

La recolecta de tejidos fue realizada los días 19 y 20 de enero del presente año, y los procesos de muestreo y manejo de vida silvestre estuvieron a cargo del equipo de médicos veterinarios y el personal auxiliar del ZooGDL; además, se contó con la presencia de algunos de los miembros del equipo del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México –pertenecientes a la Estación Chamela del IBUNAM–, que se encargaron del proceso de preservación y etiquetado de las muestras.

Durante esta actividad, se lograron obtener tejidos de 14 especies de aves entre las que se encuentran el tucán pico canoa (Ramphastos sulfuratus), el loro cachete amarillo (Amazona autumnalis), el loro frente blanca (Amazona albifrons), el loro cabeza amarilla (Amazona oratrix), el loro tamaulipeco (Amazona viridigenalis), la guacamaya alas verdes (Ara chloroptera), la guacamaya verde (Ara militaris), el aguililla rojinegra (Parabuteo unicinctus), la pava cojolita (Penelope purpurascens), el hocofaisán (Crax rubra) y el pavón cornudo (Oreophasis derbianus).

En el caso de los mamíferos, se tomaron muestras de 12 individuos pertenecientes a seis especies diferentes; entre ellas, podemos encontrar el guaqueque mexicano (Dasyprocta mexicana), el cacomixtle norteño (Bassariscus astutus), el bisonte americano (Bison bison), el mono araña (Ateles geoffroyi), y también, algunos felinos como el jaguar (Panthera onca) y el jaguarundi (Puma yagouaroundi).

Por último, se tomaron muestras de nueve especies de víboras y tortugas; dento de las cuales, podemos destacar la cascabel de diamantes (Crotalus atrox), la cascabel del pacífico (Crotalus basiliscus), la cascabel del altiplano (Crotalus scutulatus), la tortuga del desierto (Gopherus agassizii y Gopherus berlandieri) y la tortuga de caja (Terrapene ornata y Terrapene carolina).

¡Agradecemos al Zoológico Guadalajara su compromiso con la conservación y el cuidado de la fauna mexicana!

Extendemos un agradecimiento especial al personal del Zoológico Guadalajara por toda la ayuda brindada en el manejo de fauna para el proceso de recolecta de muestras: MVZ. Francisco Rodríguez Herrejón (Director del Zoológico Guadalajara), MVZ. Pablo Varela Martínez Negrete (Responsable de la Dirección Técnica), Biól. Ma. Eugenia Martínez Arizmendi (Responsable de Servicios Educativos), MVZ. Luis Soto Rendón (Jefe del Área de Primates), MVZ. José Luis Rodríguez Avila (Jefe del Área de Mamíferos), MVZ. Gonzalo Elizondo Mata (Jefe de Aves y Nutrición), MVZ. David Espinosa Avilés (Jefe del Herpetario) y MVZ. Víctor Hugo Alcantara Aguilar (Auxiliar del Herpetario), así como a todo su equipo de trabajo. También deseamos agradecer a la Ing. Angélica Najar Pacheco por su ayuda con la toma de fotografías y a la M.en C. Ángeles Romero Mayén por su colaboración con la preservación de las muestras.


Recomendaciones:

Si deseas saber más sobre el Zoológico Guadalajara, sus actividades de conservación y difusión del conocimiento sobre la vida silvestre, visita el siguiente link:
http://www.zooguadalajara.com.mx/acerca


Fotografías:


Angélica Najar Pacheco, BWPM. CC BY-NC-ND, 2015 (Creative Commons, se prohíben modificaciones y su uso comercial).

OVIS A.C. obtiene muestras de tejido del lobo mexicano para el proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México

Nota Por: Sofía de Teresa

México D.F. 5 de febrero de 2015. La cacería indiscriminada y la destrucción del hábitat han orillado al lobo gris mexicano (Canis lupus baileyi) a la categoría de especie probablemente extinta en vida silvestre (E).



Dado el precario estado de conservación de estos organismos, hoy en día es prácticamente imposible tener acceso a un ejemplar del lobo mexicano que se encuentre en vida silvestre; además, el manejo de ejemplares vivos requiere forzosamente de la participación de expertos para garantizar la seguridad y bienestar tanto de los especímenes como del personal humano que se encuentra a cargo del proceso de muestreo. Por esta razón, la Organización Vida Silvestre A.C. –OVIS A.C.– colaboró en esta ocasión con la toma de muestras de tejido (sangre y pelo) de 3 ejemplares de Canis lupus baileyi, que ya están siendo procesadas por el equipo de científicos del Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del IBUNAM, para generar los códigos de barras genéticos que formarán parte de la biblioteca pública de este proyecto.

OVIS A.C es una organización no lucrativa enfocada al desarrollo de programas de conservación de especies y manejo sustentable. Desde hace más de doce años, OVIS A.C ha participado en el Programa de Recuperación del Lobo Gris Mexicano en la UMA La Mesa, con el principal objetivo de reproducir en estado de semi-cautiverio a organismos pertenecientes a esta especie y, posteriormente, liberarlos en regiones adecuadas para su supervivencia y que se encuentren dentro del rango de su distribución histórica.

La toma de muestras realizada por OVIS A.C para Códigos de Barras de la Vida Silvestre México fue llevada a cabo entre diciembre de 2014 y enero de 2015 en la UMA La Mesa, en Marín Nuevo León, con el financiamiento de Google Global Impact Awards a través del proyecto Códigos de Barras de la Vida Silvestre México.

En 2014, el comité científico del proyecto lanzó una convocatoria a instituciones especializadas en la conservación de las especies participantes en el proyecto, y que estuvieran interesadas en colaborar con la donación de tejidos de estos organismos. OVIS A. C. presentó su propuesta para llevar a cabo el proceso de muestreo del lobo mexicano, misma que fue analizada y aprobada por dicho comité. Es importante mencionar que todos los ejemplares muestreados para este proyecto, han sido identificados por taxónomos expertos en cada uno de los grupos.

La obtención de tejidos del lobo mexicano (Canis lupus baileyi) por parte de la Organización Vida Silvestre A.C. (OVIS A.C.) constituye una gran aportación para el proyecto de conservación de especies amenazadas por el tráfico ilegal, Códigos de Barras de la Vida Silvestre México; ¡agradecemos a OVIS A.C. su colaboración con la protección del lobo mexicano!

Fuentes:

CONABIO Naturalista. Lobo mexicano, Canis lupus ssp. bailey. Consulta: 5 de Febrero de 2015.
http://conabio.inaturalist.org/taxa/197859-Canis-lupus-baileyi

CONANP, SEMARNAT. 2009. Ficha de Identificación No. 9, Canis lupus baileyi, Especies prioritarias. México.

Organización Vida Silvestre A.C. Consulta: 5 de Febrero de 2015.
http://ovis-ac.mx/

Organización Vida Silvestre A.C. Programa de Recuperación del Lobo Gris Mexicano. Consulta: 5 de Febrero de 2015.
http://ovis-ac.mx/wp-content/uploads/2014/10/Folleto-Programa-Lobos.pdf


Fotografías:

Cortesía de OVIS A.C.

Códigos de Barras de la Vida Silvestre México visita el Zoológico Regional Miguel Álvarez del Toro

Nota Por: Sofía de Teresa

Científicos del Instituto de Biología de la UNAM visitaron las instalaciones del ZooMAT (Zoológico Regional Miguel Álvarez del Toro, Chiapas) y obtuvieron muestras de organismos pertenecientes a diversas especies participantes en el proyecto. Más adelante, en el laboratorio se extraerá el ADN de dichas muestras para la generación de la biblioteca pública de referencia de códigos de barras genéticos del proyecto.

El equipo de zoólogos del IBUNAM estuvo conformado por la M. en C. Andrea Jiménez Marín (Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del IBUNAM), la M. en C. Yolanda Hortelano Moncada (Colección Nacional de Mamíferos), la Antropóloga Física Celta Gómez Trejo y el Biól. Óscar Pérez Flores.

A lo largo de estas actividades se buscó que los procedimientos resultaran poco invasivos para los ejemplares; para ello, tan sólo se tomaron muestras de plumas de aves y, en el caso de los mamíferos, muestras de pelo y heces. El personal de ZooMAT –que cuenta con una larga experiencia con el manejo de organismos vivos– asesoró a los científicos y colaboró con el manejo y captura de los animales.

Vale la pena destacar que ZooMAT también ha desarrollado una colección de tejidos preservados en congeladores, de donde también se obtuvieron algunas muestras de ejemplares pertenecientes a especies participantes en el proyecto.

¡Agradecemos a ZooMAT su colaboración con el proyecto!



Fotografías:


1, 4. Óscar Pérez Flores, CC BY–NC–ND. Creative Commons, prohibida la reproducción para fines comerciales, es necesario dar crédito para hacer uso de la imagen.

2–3 Celta Gómez Trejo BWPM, CC BY–NC–ND. Creative Commons, prohibida la reproducción para fines comerciales, es necesario dar crédito para hacer uso de la imagen.

El Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR) participa en el proyecto internacional Códigos de Barras de la Vida Silvestre México

Nota Por: Sofía de Teresa

El Instituto de Biología de la UNAM (IBUNAM), el Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR unidad Chetumal), y el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR),  se encuentran realizando actividades de laboratorio para generar una biblioteca de referencia, pública y gratuita, de códigos de barras genéticos de especies amenazadas por el tráfico ilegal. En ECOSUR, las actividades de laboratorio que están siendo realizadas para este poryecto se encuentran a cargo de la M. en C. Arely Martínez Arce.

México D.F. a 19 de noviembre de 2014. Por su experiencia con la tecnología de códigos de barras genéticos, sus distintas ubicaciones geográficas y vastas colecciones biológicas, resulta de mayor importancia la participación conjunta del IBUNAM, ECOSUR y CIBNOR al interior de este proyecto. Al respecto, la M. en C. Arely Martínez Arce (Departamento de Sistemática y Ecología Acuática, ECOSUR unidad Chetumal) menciona  "el Instituto de Biología de la UNAM, CIBNOR y ECOSUR, conforman los tres nodos del Laboratorio Nacional de códigos de barras genéticos. El IBUNAM tiene colecciones biológicas muy grandes y esa es una ventaja, porque ellos pueden tomar tejido de allí. En el caso de nosotros –ECOSUR– estamos en el Caribe, donde habitan especies endémicas de la región; por ejemplo, aquí tenemos el caracol rosado (Strombus gigas), que es una especie que se usa de manera comercial para consumo humano, pero que está en veda porque debido a esta explotación, se encuentra en riesgo de preservación. En el caso de CIBNOR, que está en el norte de México, tienen a especies específicas de la zona como la vaquita marina, que sólo se distribuyen en esa parte del país y ellos están apoyando con esas especies.

El caracol marino Strombus Gigas es una de las especies del sureste mexicano con las que se encuentra trabajando ECOSUR. Los ejemplares fueron regresados a su entorno natural después del proceso de toma de muestras. (Imagen incluida por fines didácticos).

No siempre puedes obtener permisos de colecta de especies protegidas, que además, son muy difíciles de conseguir. Por esa razón y por la necesidad de corroborar que los ejemplares están perfectamente identificados, todos los laboratorios estamos trabajando con especialistas en cada uno de los grupos. En el caso de los organismos protegidos, estos  han sido colectados por los expertos sólo para toma de muestra; estamos realizando procedimientos que permitan que los individuos puedan ser regresados a su hábitat natural. De igual forma, cuando tomamos muestras de ejemplares que se encuentran en zoológicos, también buscamos la manera de que las técnicas de muestreo no sean invasivas para los ejemplares."

Este ejemplar, pertenece a la especie Ctenosaura defensor, otra de las especies con las que se encuentra trabajando ECOSUR. Los ejemplares fueron regresados a su entorno natural después del proceso de toma de muestras. (Imagen incluida por fines didácticos.

Actualmente, ECOSUR ya realizó extracción de ADN de la mayoría de las especies que le fueron asignadas para este proyecto; cabe señalar que en ECOSUR Chetumal ya se trabajó con especies pertenecientes a tres grupos distintos de animales: reptiles, moluscos y equinodermos; siendo los dos últimos, particularmente difíciles de manejar en laboratorio para realizar extracciones de ADN que se encuentre en condiciones óptimas para generar códigos de barras genéticos, pues "los moluscos y equinodermos – explica M. en C. Arely Martínez Arce– están todo el tiempo sumergidos en el agua, y a veces compuestos como las sales marinas inhiben la amplificación del gen."

Actividades de laboratorio en las instalaciones de ECOSUR unidad Chetumal. Fotografía donada.

Para que la biblioteca de referencia de códigos de barras genéticos cuente con una mayor exactitud, los laboratorios participantes están extrayendo ADN de un mínimo de dos ejemplares por especie. Esto se debe a que la región de ADN que permite identificar a las especies, debe coincidir en organismos distintos que pertenecen a la misma especie. ECOSUR, ya cuenta con extracción de ADN de más de 30 individuos que pertenecen  a las especies participantes en el proyecto, y que se encuentran listas para ser procesados en laboratorio de secuenciación. Las especies de las que se ha realizado extracción de ADN en ECOSUR son:

Ctenosaura defensor – Iguana yucateca de cola espinosa
Ctenosaura alfredschmidti – Iguana de cola espinosa campechana
Holoturia floridana – Pepino de mar de Florida
Strombus gigas – Caracol rosado


ECOSUR Chetumal seguirá colaborando al interior de este proyecto, y próximamente comenzaran a trabajar con algunos mamíferos.

Si deseas saber qué otras actividades han sido realizadas en este proyecto, consulta la sección del blog "Avances del proyecto".

Fotografías:

1–2. Banco de Imágenes de Conabio

http://bdi.conabio.gob.mx/fotoweb/inicio.fwx

3. BWPM. Equipo del laboratorio ECOSUR Unidad Chetumal. CC BY–NC–ND. Creative Commons, prohibida la reproducción para fines comerciales, es necesario dar crédito para hacer uso de la imagen.